Category: медицина

Category was added automatically. Read all entries about "медицина".

Эбола в Техасе

BBG: В техасском городе Даллас может быть объявлено "локальное стихийное бедствие" из-за распространения вируса Эболы. Это решение активирует план действий в чрезвычайных ситуациях.

Новости из Африки -- а теперь Марбург

Какова вероятность одновременной вспышки двух разных видов геморрагической лихорадки с высокой вирулентностью и летальностью? Уже неважно.

От вируса Марбург умер медицинский работник в столице Уганды. Ещё двое контактировавших с умершим уже показали симптомы, восемьдесят человек заперты в карантине, в их числе шестьдесят медицинских работников. В этой новости столько интересного:
1. Вирус Марбург и пять видов вируса Эбола генетически максимально близки.
2. Симптомы вызываемой обоими вирусами геморрагической лихорадки, инкубационный период и смертность также идентичны или близки.
3. Первый умерший (по официальной версии) -- медицинский работник (радиолог!) в столице страны.
4. После проявления симптомов, но до анализа, первого пациента дважды свозили между больницами на общее расстояние 65км по столице Уганды, а после смерти и в день проведения анализа -- ещё на 400км для захоронения (через полстраны).
5. Персонал обеих больниц не обучен протоколам работы с такими инфекциями, потому что министр здравохранения заявил о немедленном начале этого обучения. Для понимания контекста министр назвал симптомы болезни: рвота кровью и кровотечение отовсюду.

Карты распространения прошлых эпидемий Марбурга и Эболы -- отмечена почти вся Африка южнее Сахары:


WWZ -- двое умерших "восстали"

Монровия, 24 сентября: "Поступило сообщение, что две женщины в возрасте около 40 и 60 (по имени Dorris Quoi и Ma Kebeh), умершие от вируса Эбола в разных поселениях округа Нимба, "восстали" в понедельник перед захоронением. Новость о восставших умерших создала панику среди населения округа, которое не считает восставших живыми. Это первый подобный инцидент с умершими от вируса Эбола."

Вот так вот...

Время удвоения числа заражённых вирусом Эбола

Утро, когда внезапно получаешь письмо о ситуации с эпидемией Эболы от широко известного в узких кругах человека, который пишет только об экономике и металлах, лишает утреннего напитка и принуждает к вычислительной математике.

Вкратце, есть достаточно данных для вычисления времени удвоения числа заражённых на основе динамики предыдущих инцидентов. Исходные данные: Understanding the dynamics of Ebola epidemics (Epidemiol Infect. May 2007; 135(4): 610–621. doi: 10.1017/S0950268806007217)

Данные по нынешнему инциденту Эболы пока доступны лишь в виде пропаганды от ООН: "The number of cases is doubling every three weeks." Господина Банки нужно проверять даже когда он молчит, и сопоставление его числа со статистикой представляет нынешний инцидент крайне медленно распространяющимся. При средней длительности инкубационного периода 12 дней, удвоение числа заражённых происходит каждые восемь дней. Однако эта величина сильно зависит от наличия организованных усилий по сдерживанию распространения: при их наличии коэффициент заражения ниже 1, и инфекция затухает. Для прошлых инцидентов в Конго и Уганде при организованных усилиях коэффициент заражения был 0.4 и 0.3 соответственно. Но в нынешнем инциденте при наличии некоторых усилий по сдерживанию количество заражённых растёт даже по словам господина Банки. Это ставит под сомнение его оценку времени удвоения.

Данные по прошлым инцидентам в Конго и Уганде:

Нынешний инцидент близок по параметрам к инциденту в Уганде, за исключением уровня госпитализации. Также отличие в результатах борьбы -- в прошлых инцидентах наступал перелом, после чего количество заражённых начинало сокращаться. В этом инциденте перелом не наступил, а местные системы здравохранения уже разрушены, поэтому дальнейшее развитие эпидемии уже можно считать бесконтрольным.


Количество новых заражённых и умерших по данным WHO -- очевидна экспонента:

В логарифмической шкале экспонента выглядит прямой линией и также очевидна:

При сравнении с графиками предыдущих инцидентов с эффективной борьбой, очевидно отсутствие эффективной борьбы и бесконтрольное распространение инфекции. Однако по данным господина Банки возникают вопросы -- скорость распространения даёт коэффициент заражения 1.5 (для инцидента в Уганде он был 1.34, для Конго 1.83, что даёт среднюю величину 1.59), при историческом диапазоне 1.34~3.65, который получен при несравнимо меньшем масштабе эпидемии и наличии эффективных мер противодействия. Вероятно господин Банки наверно не хочет никого напрасно пугать раньше времени, причём с акцентом на "напрасно". Но с учётом коллапса усилий по противодействию и масштаба нынешнего инцидента, коэффициент вероятно близок к базовой средней величине 2.7, то есть время удвоения числа заражённых составляет восемь дней. Для этого случая можно сопоставить масштаб бесконтрольной эпидемии (70 миллионов, хотя это лишь оценка) и время достижения этого масштаба.


При длительности периода удвоения числа заражённых 8 дней, официальном количестве заражённых ~6400 на данный момент, 70 миллионов человек будут заражены через 107 дней (13.4 периодов удвоения). С учётом некоторой неопределённости начальных условий, "закрытия" границ сопредельных государств и различий в мерах противодействия между государствами, конечный масштаб эпидемии и время его достижения могут несколько сократиться -- это будет видно в начале января на (уже логарифмическом) графике числа новых заражённых.

WWZ -- первый укус

Поток негативных сообщений о войнах, кризисах и пиках нужно иногда разбавлять, хоть пятница уже и ещё далеко. Поэтому пусть будут полные оптимизма новости биологии из Швейцарии.

AP (22.09.2014): "Работавший в Сьерра Леоне санитар был укушен пациентом, заражённым вирусом Эбола. Укушенный эвакуирован в Швейцарию, где будет содержаться в трёхнедельном карантине. Укушенный был в защитной одежде и врядли заражён. Это первая эвакуация в Швейцарию из заражённых вирусом регионов."

WWZ (2006): "Я слышал эту историю о паре, преуспевающем бизнесмене и его жене. Он был укушен. Несерьёзно, мимо крупных кровеносных сосудов. Они думали, как и многие заражённые, что на западе есть лекарство. Они добрались до отеля в Париже, и там он начал терять сознание. Его жена пыталась вызвать врача, но он запретил и приказал немедленно оставить его, пока не впал в кому. Она послушалась. После двух дней стона и возни, персонал отеля проигнорировал табличку 'не беспокоить' и ворвался в комнату. Наверно так и началась парижская вспышка."